###肿瘤样本提取 Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别 sub_tumor<- subset(seur...
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zhuang_gj 2020/10/11 ssGSEA算法原理及应用[#ssgsea%E7%AE%97%E6%B3%95%E5%8E%9F%E7%90%86%E5%8F%8A...
最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程,但是发现了几个不一样的地方,所以重新整理流程,代码主要来自原作者Juan_NF。 文...
尝试过两个方法下载探针矩阵数据:1.GEO网站直接下载txt。 probeMatrix<-read.table("GSE16011_series_matrix.txt",se...
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RNA-Seq 分析流程:多时间点样本分析实战(一) 小鱼爸 2023-07-12 简介 了解基因表达的时序动态变化是生物学的一个基本问题。此教程提供了多时间点数据的分步实战...
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