请问.rstudio这个文件夹在哪里呢?
如何解决RStudio Server: R is taking longer to start than usualRstudio server 在运行的时候自己断掉了,重新登录提示:RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
请问.rstudio这个文件夹在哪里呢?
如何解决RStudio Server: R is taking longer to start than usualRstudio server 在运行的时候自己断掉了,重新登录提示:RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
immunedeconv包号称可以利用多种算法进行免疫细胞比例计算,包括quantiseq、timer、cibersort、cibersort_abs、mcp_counter...
immunedeconv这个R包是一个免疫细胞比例估算集大成者,把常见的免疫细胞估算的算法都包括进去了,包括quantiseq、timer、cibersort、ciberso...
TCGA风险模型类生信文章中,经常会对高低风险组进行16种免疫细胞和13种免疫功能评分的比较,就会用到一个29个免疫特征的基因集(16种免疫细胞和13种免疫功能评分),如下图...
0.缘起 很多文章中用到GEPIA这个网页工具来进行TCGA和GTEx表达量的联合比较,但在此之前我不知道要怎样在R语言中实现。这个GEPIA的文章里说: The imba...
veen_eles = list(`Filt_low_umi\n(300)` = umi_low,
`Filt_high_umi\n(8000)` = umi_high,
`Filt_high_mito\n(14%)` = mito,
`Filt_high_ribo\n(3%)` = ribo)
library("ggVennDiagram")
这里提示没有umi_low
复现2:AD与Normal细胞类型水平的差异基因挖掘(snRNA-seq)Single-nucleus transcriptome analysis reveals dysregulation of angiogenic endothelial c...
前面小编跟大家分享过一些科研热点相关的基因集 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
前面小编跟大家分享过一些科研热点相关的基因集 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
做实验的朋友们对这个问题应该是很感兴趣的,因为涉及到后续能不能实验验证。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文献,查网站。我知道的:uniprot、PDB、the human...
最近写了个内部用R包,里面有不少依赖包,一部分是CRAN的,一部分是Bioconductor上面的R包,于是把这些包分类后,按照生信技能树培训班时的代码写到了文档里面。主要涉...
之前把服务器放在家里,通过花生壳软件进行内网穿透,采用http协议进行映射。后来由于一些原因,http协议不能使用了,只能使用https。这个时候花生壳软件映射Rstudio...
ssh进行linux远程登录时,用户名、服务器名字都是一片白,也不显示时间,如下图: 生信技能树卖萌哥老师提供了两句代码: 直接在ssh(以xshell为例)登录后界面中粘贴...
@16fdc427cd90
pdf(file="x.pdf",width=8,height=6)
plotly::ggplotly(rssPlot$plot)
dev.off()
试试
pySCENIC的转录因子分析及数据可视化(三)参考生信技能树:pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
STRING进行的PPI分析?
pySCENIC的转录因子分析及数据可视化(三)参考生信技能树:pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
library(SCENIC)一下,看你SCENIC包安装成功没有。
pySCENIC的转录因子分析及数据可视化(三)参考生信技能树:pyscenic的转录因子分析结果展示之5种可视化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
TCGAbiolinks包常用来TCGA的下载和各种常用分析,本人在使用TCGAbiolinks下载和整理TCGA临床信息时碰到一些麻烦,具体如下: TCGAbiolinks...