The BioGRID interaction database: 2019 update BioGRID(Biological General Repository for...
发简信
IP属地：上海
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BioGrid:满足所有各种互作关系数据需求的数据库 -
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CIBERSORT：反卷积推测bulk中的细胞类型五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT，这个包其实很早就想学的，因为现在一般的单细胞文章的套路，很难不用到它，那么它能干什么呢？它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
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WSL2安装ubuntu及修改安装位置本人小白一枚，因为生信分析的需要开始学习Linux。使用visualbox等虚拟机运行Linux有时会没有那么流畅，想试试看WIN10自带的WSL2来使用linux。这里总结...
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【6】蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant1.简介 2016年，德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQuant软件（MQ），并发表在nbt上，protocol也相应发表在n...
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featureCounts 得到的counts计算 cpm、 tpm、FPKM
一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言，RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到的上游软件就是featureCounts和Salmon了，在这两类软件的...
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蛋白质组学中对缺失值的处理
蛋白质组学数据中经常存在缺失值（missing values）,特别是对于非标记定量蛋白质学（DDA或者DIA），都存在相当一部分缺失值。首先说说缺失值的产生机制： 完全随机...
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featurecounts的使用说明官网：http://subread.sourceforge.net/ 一、原理 文献参考：featureCounts: an efficient general purpos...
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如何进行高维变量筛选和特征选择(一)？Lasso回归01模型简介 随着海量电子病历的挖掘，影像学、基因组学等数据进入医学统计分析，经常会面临对高维变量特征选择的问题，Lasso回归是在线性回归模型的代价函数后面加上L1范...
