参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemb...
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R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析 -
UpSetR：集合可视化神包对于集合的可视化，第一时间想到的都是韦恩图（venn diagram），一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加，比如...
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第一次使用R爬取自己所需要的数据打开网站 http://rice.hzau.edu.cn/rice/clone/list.php?page=1&searchword= 1、找规...
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pheatmap
一、 创建一个随机矩阵10x20 二、作图１.基本作图 scale是指对数值进行均一化处理，在基因表达量的数据中，有些基因表达量极低，有些基因表...
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简书笔记汇总
以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Lin...
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ggplot2： 用这种方式添加的参考线，你见过么？前言 ggplot2做为R语言中画图的包，我想大家应该都不陌生，这个包可以解决大部分的画图需求。说到绘图，有时候为了方便了解数据的分布，我们...
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如何使用ChromHMM鉴定染色质状态趁着零碎的时间整理了下ChromHMM的相关内容。 ChromHMM是基于ChIP-seq组蛋白数据检测染色质状态的工具。 基因组区域特定的组蛋...
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如何处理NGS数据中的污染？
本次文章和大家讨论一个大家可能胡遇到很常见的一个问题，在测序中我们很难避免引入一些微生物污染或者人类的污染，例如，我想测序拟南芥，其中由于实验员...
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【三维基因组】PyGenomeTrack之CHIP峰图可视化很多时候我们都需要画chip的峰图，而pyGenomeTrack（https://pygenometracks.readthedocs.io/e...
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使用pyGenomeTracks绘制表观展示图pyGenomeTracks是什么 首先在介绍pyGenomeTracks之前， 先说几个常用的表观组学数据展示工具，IGV，UCSC和Wash...
专题公告
积累的过程--生信相关简文~~
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