看文献偶然发现一位大神,简直是行走的SCI机器。下面就来逐渐学习下这位大神的文章。 首先来学习这篇近期发在预印本上的生信文章: 题目: 1.整体思路 2.结果解读 2.1 高...
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一般SCI论文投稿的时候都是需要准备一封Cover letter的,有可能个别期刊不需要。如果期刊需要提交一封Cover letter,纯生信SCI论文需要注意什么呢?怎么样...
本文写于观看生信技能树公众号(vx: biotrainee)的七步走纯R代码通过数据挖掘复现一篇实验文章(第1到6步)[https://mp.weixin.qq.com/s/...
复现文章:Discovery and Validation of a Metastasis-Related Prognostic and Diagnostic Biomark...
1.构建DESeq2对象 (1)从SummarizedExperiment对象构建DESeqDataSet对象 se为RangedSummarizedExperiment对象...
2021.11.12 初版2021.11.16 更新单因素COX输出结果,多了半边括号...本系列主要用于通过使用训练集(train)、内部验证集(test1组)、外部验证集...
1、富集分析的背景知识 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/0b938d0e652c]2、clusterprofile富...
最近用之前写的R脚本重新跑数据时,出现了报错。经检查,才发现是数据的列名读入R时发生了变化,列名前自动加上了X.符号。 read.table系列函数有一个check.name...
查看目录下文件 p值标星 批量替换表格中的NA 看数据的变率 跳过 切割数据 7.增加一列 8.选择 9.多个向量取交集
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做通路富集分析常需要批量进行基因ID转换,总结了3种简便方法与大家分享。方法1和2依赖于基因组注释R包,如果无相应物种R包就必须用方法3。好在的是常用物种人、小鼠、大鼠等都是...
开门见山,直接上图 TCGA barcode 是TCGA项目中生物样本数据的主要标识符,接触过TCGA数据的人想必对这一串由数字、字母和短横线所组成的字符并不陌生,那么这一串...
今天用select函数出现报错,一开始没注意报错信息,因为我选择的列名有些复杂,怕是哪里掉了个空格,就重新换了个方法选列名,还是出错。报错信息如下 简单说,就是不知道为a这个...
这个教程目的在于介绍apply()家族在R语言的用法,apply()函数算是R语言里面很基础的一个函数,同时还有sapply()、lapply()、tapply()函数精简了...