啤酒泡

@铁线莲 你好，请问stairway plot中的参数L是如何计算的呢，我一直没弄明白

种群动态历史评估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）

SFS的基本理解、介绍的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...

杨康chin

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啤酒泡

你好，老师！最近在研究你这个脚本的用法，可以我总是一运行就出现问题。
The drictory is: D:\worksoftware\callCodeml-main\paml
The treeFile is: D:\worksoftware\callCodeml-main\31.nwk
0%| | 0/78 [00:00<?, ?it/s]
2021-08-11 00:26:27 Staring ModelA null of accD_mafft ...
0%| | 0/78 [00:00<?, ?it/s]
Traceback (most recent call last):
File "callCodeml.py", line 191, in <module>
main()
File "callCodeml.py", line 178, in main
run(path_seq, name)
File "callCodeml.py", line 140, in run
res_null = call_codeml('null', path_seq, name)
File "callCodeml.py", line 117, in call_codeml
b = subprocess.Popen(['codeml', f'{path0}/WorkingDrictory_{start_time}/{name}/{type}/{type}.ctl'], stdout=subprocess.PIPE)
File "C:\Users\yangz\anaconda3\lib\subprocess.py", line 858, in __init__
self._execute_child(args, executable, preexec_fn, close_fds,
File "C:\Users\yangz\anaconda3\lib\subprocess.py", line 1311, in _execute_child
hp, ht, pid, tid = _winapi.CreateProcess(executable, args,
FileNotFoundError: [WinError 2] 系统找不到指定的文件。

能否指教什么问题，找不到指定文件？

选择压力分析，从序列下载到结果绘图

选择压力及基因在进化过程中所受到的压力，也称自然选择。 在遗传学中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同义突变频率(Ka)和同义突变频率（Ks）之间的比例。 一般认为，同义...

byemax

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