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    ATAC-seq建库实验总结

    作为一个科研垃圾,因为足够幸运所以考上了北大,浪费着老板的资源,一天花掉4万块钱都算小事。 ATAC-seq建库实验失败经验总结: 错误点: 过...

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    质控

    输入文件数据names(inputFiles) <-c("AS1_ATAC","ERA_pbmc_1","ERA_SF_1_ATAC","ERA...

  • 单细胞技术的背景介绍

    二代测序技术(NGS)近几年来迅猛发展,应用于多种复杂的生物学体系中,例如肿瘤基因组、微生物种群等。基于NGS的各种技术(基因组、表观组、转录组...

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    Waddington-OT(Optimal-Transport )

    细胞逐渐发展成一个终末基质状态或者上皮间质转换的状态。mouse embryonic fibroblasts (MEFs) into iPSCs...

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    使用grade of membership 模型可视化RNA-seq数据结构

    目前有的一些聚类方法:基于距离的层次聚类、k-means聚类、自组织映射(SOMS)。传统的分析方法就是将组织分为具有相似的表达谱的patter...

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    生信文件格式一文就够

    fasta格式是最基本的表示序列信息的格式。是一种文本格式,一般以后缀.fa或者.fasta 主要由两部分组成: 第一部分 以>符号开头,定义行...

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    生信学习第一篇-Fastqc分析简略版

    二代测序数据评估软件: FastQC 测序质量分析: 包含多项内容,如测序reads碱基质量、GC含量、reads长度、k-mer分布 Basi...