你用Rstudio 和Rproj 就好了
Rmarkdown 设置工作目录Rmarkdown 怎么设置工作路劲 Rmarkdown里面setwd()没用,个人感觉Rmarkdown里的路径乱七八糟的,不知道自己的文件输出到哪里去了,所以在使用Rma...
在单细胞数据分析中,在确定细胞类型后,除了可以进行差异表达基因分析外,还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析,这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
每一个都得都是na是什么情况
将TCMSP 数据库信息匹配uniprot由于tcmsp 中选择药物靶点信息,给出的结果只有target name, 因此需要添加额外的gene symbol 信息。 从uniprot 中下载数据文件 因此首先下载u...
中文应该只有我写了这个。。 “ DivE”估计量是一种启发式方法,用于估计种群中的种类数量或物种数量(物种丰富度)。 文章 Quantification of HTLV-1 ...
随缘记录自己看到的一些文章文献以及一些工具,又因为主要内容和生信可能比较相关,写作随缘,更新随缘,故名缘信,过去的一周为第47周,为本刊第一周 文章 Temporal Dyn...
咋不去看我的代码😝
爬虫--R语言--基础知识爬虫--R语言--代码实战(以豆瓣网站为例) - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/ac8154e1fa2c]爬虫--R语...
是的 视频质量非常高
转录组测序原理参考: https://www.bilibili.com/video/BV1XJ411r7bJ/?spm_id_from=333.788.videocard.0 定义 而转录...
我对于parallel并行的简单理解即同时执行多个命令语句。它与For循环语句的逐条运行的思路大相径庭。尽管目前很多生信软件支持多线程运行(一条命令语句内),但并不是设置的越...
新的任务,找到这 276 genes encompassed nine major DDR pathways:base excision repair (BER),nucle...
你可以去NCBI 上查一下,可能是更换数据保存的链接了
全基因组分析实践(参考:碱基矿工)参考:碱基矿工从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第4节 构建WGS主流程GATK4.0和全基因组数据分析实践(上) 前言 由于人类基因组数据过大(我的小小服务器也只有50...
@f15ec39b9fed 使用conda 安装会方便很多。如果是自行安装的话,全局调用得将它添加到环境。否则必须找到对应路径的文件调用才行。
全基因组分析实践(参考:碱基矿工)参考:碱基矿工从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第4节 构建WGS主流程GATK4.0和全基因组数据分析实践(上) 前言 由于人类基因组数据过大(我的小小服务器也只有50...
气泡图用R,clusterprofile 包可以画。hsa 是人类,出现KO 可能是有问题吧。另外,其实富集分析直接用上面那个包也可以做,非常方便
使用Metascape进行GO及KEGG分析参考: https://www.bilibili.com/video/BV1K741127FK/?spm_id_from=333.788.videocard.1部分图片来源于...
title: DALS017-高维数据推断2-统计原理date: 2019-08-17 12:0:00type: "tags"tags: 高维数据categories: Da...
对应原版教程第14章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html[http://bioconductor....
测序原理可以慢慢消化
基因测序技术总结参考: 从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第1节 测序技术作者:碱基矿工参考:【陈巍学基因】视频1:Illumina测序化学原理 前言 什么是全基因组测序? 全基因组测序...
只是搬运知识点罢了
基因测序技术总结参考: 从零开始完整学习全基因组测序数据分析:第1节 测序技术作者:碱基矿工参考:【陈巍学基因】视频1:Illumina测序化学原理 前言 什么是全基因组测序? 全基因组测序...
以下是我简书里所有的文章链接,按不同的专题分类,方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...