写在前面 硕士毕业做的大豆内参基因的筛选,当时用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三个软件,geNorm 不需要多说,Vandesompele教授的...
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单倍型与单核苷酸多态性(SNP)有关,因此需先了解SNP。 单核苷酸多态(SNP):指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。在人类基因组中,SNP占人类基...
主要参考 祝让飞 的文章及 Tufts 网站中的信息,特此致谢。 首先放一张测序示意图,在DNA片段两端所加的序列即接头序列,也就是我们今天要讲述的主角。 1 基本概念 1....
Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system 这篇文章真的看了好久,就算一开始秉承着不求甚解的精神都看不下去,有太多的专业背...
前言 我之前写过这篇文章的精读笔记:单细胞好文2--Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity an...
Seurat Weekly NO.0 || 开刊词 在过去的一周里Seurat社区在github总提问数由上周的3066上升到3090,当然有同一问题反复讨论的情况,也有之前...
2017年7月2日的下午仿佛就在昨天,一个拉着行李箱的应届毕业生,站在开发区B座三栋楼的中间,看着大大的公司LOGO:终于到了,是的,没错了。 那时候的我不会预料到,在接下来...
作为纪念开个专栏:每周精选Seurat社区有趣的问答以飨国内Seurat的用户。 为什么要做这个事情呢? 翻译学习法 认知学习法 通勤学习法 追踪工具动态 相信我,你并不孤独...
R way -- P7 今天是在“生信星球”小组学习的最后一天了,从第一天的“培养自己搜索的意识”开始,到今天的“关于测序那些事儿”,中间接触了Linux和R语言,因为花花提...
测序的世界很奇妙,不同的数据处理可能得出不同的结论,入门生信首先要做的就是了解你的数据还等什么?跟我一起来探索吧~ 测序原理: 早期如何测序呢? 如果给你这么一串珠子,让你统...
R way -- P6 一劳永逸地设置国内镜像 保存,重启Rstudio 用options()$repos来检查镜像地址 R包的安装 install.packages(“包”...
R way -- P5 Tips 读取文件时,read.table(file = "filename" , sep = "\t" , header = T ) ,其中sep是...
R way -- P4 R 和 Rstudio 的安装问题 之前遇到过在Rstudio中画图报错的原因,排查了很多因素都无果,后来知道了是中文用户名的缘故,百度到一个新建一个...