问题详解:ssh远程登录centos系统,离开一段时间后,ssh窗口自动断开,有时会影响前台运行的任务,故而进行解决。1、我们编辑sshd_config文件。vim /etc...
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目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https://www.jianshu.com/p/d9bd081763...
该系列主要介绍了 MUMmer 软件下核苷酸序列比对程序 nucmer 的使用,计算操作见前两篇推文; 序列比对软件 MUMmer 快速上手(一)[https://www.j...
MUMmer 4 是一个快速比对 DNA 或蛋白序列的软件,最常用的 program 就是 nucmer 和 promer,分别是比对核苷酸和氨基酸序列的,接下来以 nucm...
关于该软件的计算可选参数以及结果文件的解读,见前三篇分享: 序列比对软件 MUMmer 快速上手(一)[https://www.jianshu.com/writer#/not...
通常circos的中间部分不是空白区域,会用一条条线进行连接,表示两个染色体部分区域有关系。 数据格式 对于link,circos要求输入数据至少有6列,分别是chr1 st...
这一部分承接 从零开始学CIRCOS绘制圈图(四),对之前的布局进行调整,使结构更加适合于发表。 染色体的位置顺序 默认情况下是会显示所有的染色体,而且会先从ath1到ath...
在从零开始学Circos绘制圈图(一)我们已经绘制出一个比较丑的circos图,这一部分是讲解一些细节。 这一部分会从上一步的两个文件开始,分别是 karyotype.tai...
前言 看了这么多期的 circos,都有点乏了,换换口味也是好的。 下面,咱就开始吧。 做生信分析,总是免不了要给基因 ID 和 Symbol 转换来转换去。 方法 一般要进...
上下简单合并 merge(df1, df2, all = T) dplyr的join系列合并数据框 library(tidyverse) —— 加载tidyverse包ful...
拍照注意事项 首先图像在拍的时候要保证: 不变倍镜 不变焦 不改变曝光(手动曝光) 顺序拍照 连续两张照片之间保证至少1/2的图像重叠 同一组图像保存在同一个文件夹下 拼接图...
很多人认为,海森堡测不准原理(不确定性原理)是关于观察者通过光子与电子相互作用,从而影响光子的动量的理论。 观察者必须影响电子的动量(或某些量子状态)才能观察到它,这可能是真...
一、写在前面 扣扣群:559758504(目前无需验证,一键即可加入) 如果你不想学,老板又催着要,你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ ),但还是自己学,知识都是自己的。...
这一篇会在 从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)基础上开始在circos绘制基因密度信息。为了保证一致性,可以新建如下几个文件 circos.conf: karyotype....
一般基因组文章都会有下面这种酷炫图,用来描述基因组的基因密度分布,转座子的密度分布,和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系,以及其他各种你只要测序就能加上的信息,比如...
CentOS 7 Linux系统里没有git clone命令怎么办? 第一步:需要确保CentOS 7操作系统已经正确安装和配置。还需要确保服务器上已经安装了必要的软件包和依...
序列格式转化推荐看看SeqKit,TBtools等已有软件,能用则用。 fasta格式转fastq格式 比对软件比如bowtie并不支持比对fasta格式的文件,所以需要把f...