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MACS2是peak calling最常用的工具。 callpeak用法 这是MACS2的主要功能，因为MACS2的目的就是找peak，其他功能都是可有可无，唯独callpe...

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Salmon 是转录本定量软件，使用转录本定量主要优点一是更准确，比如不同样本同一基因使用不同 isoform 此时基因长度并不相等，直接基因定量无法顾及；二是方便进行可变剪...

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首先，明确一个概念，进化中常提到的突变一般是指生殖细胞的突变，或种系细胞突变；发生在体细胞内的突变一般不会影响后代的性状，而发生在生殖细胞内的基因突变会影响后代性状。 野...

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1. 非模式生物 非模式生物需要提前从AnnotationHub抓取目标物种的OrgDb数据库，这个库里包括Uniport，ENSEMBL，ENTREZID，REFSEQ，G...

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ggforce基于对ggplot2的扩展，可以更好的展示相应的视图，并根据数据绘制轮廓以及区域放大。1.形状的扩展与收缩 ggplot(datapoly, aes(x = x...

生信学霸

相关性基础知识 “ 相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向，但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相...

生信小鹏

使用R进行数据分析的时候，我们输入的数据大多为宽数据，为了适应R数据的作图要求，需要将宽数据转变为长数据。应该说这是长宽数据转变的重要原因之一。 什么是长数据长数据一般是指数...

caoqiansheng

R语言基础画图使用函数par()以及layout()将多个图形组合在同一幅图中，但是这两个函数不适用于ggplot2和ggpubr,ggplot2和ggpubr作图如果希望把...