主成分分析（Principal component analysis，PCA）是将多个存在相关关系的变量，降维为几个互不相关的指标，也就是主成分。我的数据相对来说，有点复杂，...
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3.表型数据：主成分分析 -
全基因组选择的模型汇总（转载）本文转载自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。个人感觉非常好。如有侵权，请联系我。...
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3 - BLUP的基本特性及求解方法回顾上一次的一个OLS, GLS，SI, MME的发展示意图： MME是Henderson将混合模型的转换得到 1 MME的起源 Henderson提出，其想法是结合OLS与...
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使用 docker 搭建 linux blast 环境，进行本地 blast 分析
启动 docker（启动前肯定是先进行 docker 安装和 liunux 环境的下载，如需本步，下次进行介绍） 创建镜像并创建新用户 安装必要基础软件 安装 blast 并...
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linux添加中文字体linux系统中默认没有中文字体，进行网页设计或者报告设计时需要对字体进行设置，这时很多时候需要添加中文字体 首先，可以使用fc-list查看现在的字体image.png 如...
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perl 安装包工具cpanm及lib路径设置
使用cpanm进行安装cpanm本身是个文件，地址：https://raw.githubusercontent.com/miyagawa/cpanminus/master/c...
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RIdeogram：染色体数据可视化的R包已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在线工具Idiographica，虽然能绘制直的...
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使用RIdeogram绘制染色体图谱参考文章：https://www.jianshu.com/p/07ae1fe18071需求描述：我想绘制差异表达基因在染色体上的分布，或开放染色质在染色体上的分布或CTCF在...
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karyoploteR: 画一个测序深度分布图测序深度的分布图是很常见的一类图，可用于发现染色体片段或整条染色体的缺失或是重复。如果是缺失，测序时捕获的概率就小，最终比对呈现出来的就是有一段区域深度明显偏低；如果是重...
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SNP在染色体上的密度分布图有两种方法，先看比较简单的一种： 结果： 第二种方法就比较复杂了，需要准备两个文件：一个是包含染色体长度的文件chr_length.txt，格式如下： 一个是包含各个基...
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linux间免密登录
生成公钥 ssh-keygen -t rsa 不改名字 生成 注意:.ssh目录的权限必须是700.ssh/authorized_keys文件权限必须是600上述操作必须在两...
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Genome-wide association mapping reveals a rich genetic architecture of complex traits in Oryza sativa
11年的NC 的文章群体进化-GWAS分析
群体进化-gwas分析 群体进化基础分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一种使用最广泛的数据...
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你好，咱这个划 bin 的代码有文献可引用或者基于那篇文章来的呢？
binmap-123
原网址：1）http://www.jintiankansha.me/t/etiz287dU8 2）http://www.jintiankansha.me/t/i81Con4f...
个人介绍
毕业于山东大学，具有6年生物信息分析工作经验，一直从事动植物及人的重测序方向。擅长群体重测序及GWAS分析；进行过NIPT，CNV，肿瘤ctDNA，遗传肿瘤等人类健康方向相关的分析；使用linux，perl，R，git等