写在前面：经常做转录组分析，就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择，能直观比较各种处理带来的影...
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转录组DEGs聚类热图和功能富集分析 -
Hisat2+FeatureCounts+DESeq2流程+作图！featureCounts是一个用来统计count数的软件，运行的速度飞快，比之前用的htseq-count快了好多好多。 照例先说一下怎么下载...
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FastpFastp简介 fastp是一款数据质控过滤软件，作者是陈实富，来自深圳海普洛斯公司。该软件可以实现fastqc-Trimmomatic-fas...
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转录组综合分析包TomicsVis | 最终还是有人做了!!!!写在前面 这个包最终还是有人做了，前面的微生物中Wen Tao&Yong Xin Liu在Protein & Cell IF 21.1中发表了T...
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day44 转录组软件安装 北鲲云
经历了一周的时间在学校服务器上痛苦的安装各种软件，各种软件冲突，各种报错，各种conda连接问题，换源，没有GLIBC2.14问题，LC_ALL...
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RNA-seq入门（一）数据下载和格式转换进入NCBI官网后选择GEO，输入GSE183976，进入数据下载页面。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/qu...
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conda下载及安装以前做生物信息都需要去各种各样的生物软件官网进行软件下载，不过现在有一个conda就够了。它就像是我们windows系统里的360软件中心，大部...
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RNA-seq入门（二）质控及fastqc报告解读一、质控 前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件，现在需要对fastq文件进行质控，这里用的软件为fastqc。首先建好文件夹用...
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RNA-seq入门（三）比对、输出表达矩阵一、hisat2进行转录组比对 1. 首先下载参考基因组 在NCBI,UCSC和Ensemble数据库都可以下载到参考基因组，这里下载UCSC的...
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转录组上游分析教程 | 课程介绍引言 大家好，我是小杜。 从2022年开始关注的同学知道，“小的生信筆記”面对的对象是针对零基础的同学，尤其是自学的同学。我感觉对于这些同学多多...
专题公告
玩转转录组分析，你也可以的！
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