特别声明：本部分（系列）内容均来自顾祖光博士对ComplexHeatmap的介绍，仅为学习交流，尊重原创。 热图系列我们已经有： R可视化之ComplexHeatmap【一】...
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R可视化之ComplexHeatmap【四】：热图小方格个性化修饰、提取亚集及热图信息 -
WGS分析笔记（2）—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前，先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping，一般推荐...
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Linux Top命令之load average详解
前言 因为笔者面试中被问到了这个问题,感觉自己不是很清楚,所以还是整理一下,博客中也有不少讲到top命令的,但是几乎没看到有把load average这个讲清楚的,所以还是有...
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服务器集群与PBS任务管理系统的常用命令1. 服务器集群 服务器集群就是指将很多服务器集中起来一起进行同一种服务，在客户端看来就像是只有一个服务器，集群可以利用多个计算机进行并行计算从而获得很高的计算速度，也可以用...
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如何投递任务、监控任务和终止任务；(user)现有的新服务器上运行程序一定要进行任务投递，将程序交由任务管理系统统一调度 现有的新服务器上运行程序一定要进行任务投递，将程序交由任务管理系统统一调度 现有的新服务器上运行程...
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生信常用数据库（四）：NR数据库分类搭建前言 因为完整的NR数据库下载下来后数据量非常庞大，在我们做序列比对的时候，尤其是很多很大的序列比对的时候，特别消耗计算资源和内存，最重要的是很耽误分析的周期，因此将NR...
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如何从NT/NR数据库中提取子库最近做有关小鼠肠道微生物宏基因组，遇到两个问题，一是数据量太大，二是宿主污染严重。 估计宿主污染至少80%左右，因而就想通过一些方法，例如kraken、bowtie等把宿主污...
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使用SOAPfuse进行融合基因的分析
欢迎关注”生信修炼手册”! SOAPfuse是华大开发的一款，专门针对human的融合基因进行分析的工具，项目链接如下 http://soap.genomics.org.cn...
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网络数据的统计分析-R语言实战资料：《Statistical Analysis of Network Data with R》 语言R常见的网络分析包： 基础网络操作、可视化于特征化： igraph、ne...
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利用R语言作PPI（免String网页和安装cytoscape法）原创来自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw，本人稍作修改，原文是针对小鼠，现改为人类当得到差异基因后，很多时候...
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我以为热图只能画数值型数据，没想到离散型的也行啊离散热图 0.需求 今天在群里看到一个非常漂亮的热图，我以为是什么奇怪的新R包画的，转了一圈发现原来还是大名鼎鼎的ComplexHeatmap丫。今天的代码都是在作者写的书基...
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limma包中的数据对象（data objects）
limma包主要生成和使用6种数据对象（data objects) EListRaw全称Raw Expression list. 储存normalization前的singl...
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R GEOquery: Timeout of 60 seconds was reached 解决办法
`感谢各位简友一直的关注。 请关注：感谢陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891...
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bam文件过滤和去重复
最近处理的几组数据使我感觉到生信软件的教程一定要看最新的或官方的，因为现在的技术和方法发展太快了，软件更新换代也非常快，每一个版本都可能有细微的区别，网上找到的几年前的教程可...
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R语言 write.csv时报错 unimplemented type 'list' in 'EncodeElement'
在导出数据时报错： 查看数据结构发现有list的成分所以将其unlist后重新合并 或者 问题解决
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2023年献别礼------科服vs临检（肿瘤报告的解读）作者，Evil Genius 2023年马上结束了，不知道大家今年的任务完成了多少，如果顺心如意就继续保持，如果坎坷不断，就砥砺前行，人生唯一确定的是不确定的人生，当下的苟且...
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非常感谢，错误已更正
9. ggplot2中expand参数
我们似乎没有担心过数据点被画到axes之外，这是因为ggplot2会在data range和axes之间加一些padding，以保证数据和坐标轴不会重叠： 来自scale...
